肾位于腰部，左右各一。藏精，主水液，主骨，生髓，开窍于耳，司二便，其华在发。
肾脏所藏之精的来源包括先天之精和后天之精两个方面。先天之精受之于父母，也就是形成胚胎的原始物质，它有促进生长和繁衍后代的能力。后天之精是饮食物营养物质所化生的，具有滋养全身脏腑、组织和器官的作用。
肾中阳气主持水液代谢，主要表现在其升清降浊的作用。水入于胃，由脾上输于肺，肺气肃降，则水下流而归于肾，这是水液在体内升降的过程。
下降于肾的水液，又分清浊，通过肾中阳气的气化作用，再使清者上升归于肺而布散周身，浊者则输于膀胱而排出体外，如此循环，来维持人体水液代谢的平衡。
如果肾气不足，气化失常，就会引起水液代谢的障碍而导致疾病。《素问·水热穴位》说：“肾者，胃之关也，关门不利，故聚水而从其类也。上下溢于皮肤，故为附肿，附肿者，聚水而生病也。”又说：“诸水皆生于肾”。
如果肾中阳气不足，摄納无权，气便不能收纳而上浮，会出现喘息的病变。所以有“肺主呼吸，肾主納气”的说法。
肾主骨生髓，肾藏精，精生髓，髓藏于骨中，滋养骨骼，所以有“肾主骨”的说法。肾精充足，则骨髓生化有源，骨骼得到髓的滋养而坚固有力。
如果肾精虚少，则骨髓化源不足，不能营养骨骼，则会出现骨骼脆弱无力，甚至发育不全。
“齿为骨之余”，肾主骨生髓，所以牙齿有赖于肾精的充足，肾精充足则牙齿坚固，肾精不足，则牙齿动摇，甚则脱落。
脊髓上通于脑，脑为髓聚而成。《灵枢·海伦》说：“脑为髓海”。所以，打通脑髓，也可提升肾精。
毛发的润养来源于血，但发的生机又根源于肾气。发的生长与脱落，润泽与枯槁，与肾的精气盛衰有关。青壮年肾精充沛，毛发光泽，老年人肾气渐衰，毛发变白而脱落。
如果肾气不足，则会出现耳鸣、听力减退等情况。一般虚症的耳鸣耳聋与肾有密切关系。
尿液的储留和排泄虽在膀胱，但要依赖肾的气化，当肾气不能蒸化时，小便即不通利，而肾气不能固摄时，又可使小便失禁。在肾气衰弱时，往往大便也会失禁。
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